מזרח אפריקה, כולל קניה, נפגעה קשה על ידי דפוס מזג האוויר הזה, אשר מחמיר על ידי תופעת האקלים אל נינו. אל נינו הוא דפוס אקלים טבעי שיכול להוביל לחיום מוגבר ולבצורת באזורים מסוימים ולגשמים כבדים באזורים אחרים. הרשויות הזהירו את הקניאים להישאר ערניים, כיוון שמצפים לגשמים כבדים נוספים בימים הקרובים, בעוד המונסון ממשיך להשפיע על מזרח אפריקה. דובר ממשלת קניה, אייזק מוואורה, דיווח על 70 מקרי מוות בשל שיטפונות שנגרמו כתוצאה ממגפות חזקות במדינה. נאירובי הושפעה באופן משמעותי, עם כבישים חסומים ובתים באזורים עוני נבלעו. הממשלה תספק עדכון מפורט לאחר פגישה עם ועדת התגובה למקרי חירום. קנאים הומלצו להישאר ערניים כמו גשמים כבדים יותר צפויים. בטנזניה השכנה, לפחות 155 אנשים מתו בגלל שיטפונות ושרידות אדמה. ראש ממשלת טנזניה קאסים מאג'ליווה דיווח כי יותר מ-200,000 בני אדם נפגעו מאסונות במדינה, וכתוצאה מכך 155 הרוגים ו-236 פצועים. בתים, רכוש, יבולים, ותשתיות כולל כבישים, גשרים, רכבות, ובתי ספר נפגעו או נהרסו. בבורונדי, כ 96,000 אנשים הוצאו מבתיהם בשל גשמים כבדים במשך מספר חודשים. האו"ם והממשלה דיווחו על התפתחות זו. בנוסף, סוכנות ההגובה ההומניטרית של האו"ם, OCHA, הצהירה כי גשמי גו העונתיים של סומליה מאפריל עד יוני התגברו, וגרמו לשפעות פתאומיות מאז 19 באפריל. ארבעה אנשים נהרגו, ומעל 800 נפגעו או הוצאו מבתיהם ברחבי המדינה. אוגנדה חוותה סופות חזקות שהובילו לפריצת גדות הנהר, שגרמו לשני מקרי מוות ולפלישת מאות כפריים. זה בא אחרי יותר מ 300 מקרי מוות בקניה, סומליה ואתיופיה מהצפות בסוף השנה שעברה, בזמן שהאזור התאושש מהצורת הגרועה ביותר מזה ארבע עשורים. בשנים 1997-1998, שיטפונות גדולים הובילו ליותר מ- 6,000 מקרי מוות בחמש מדינות באזור.