یورپی یونین نے بھی دوسرے ممالک کے ساتھ اسی طرح کے معاہدوں پر دستخط کیے ہیں ، لیکن آڈیٹرز نے غیر سرکاری تنظیموں کی صلاحیت کے بارے میں خدشات کا اظہار کیا 6 بلین یورو کے معاہدے کے تحت منصوبوں کو چلانے کے لئے 2016 کی بغاوت اور مخالفین پر کریک ڈاؤن کے بعد سے ترکی کی آمریت کی باری کی وجہ سے۔ یورپی یونین، جو جون میں یورپی پارلیمنٹ کے انتخابات کر رہی ہے، غیر قانونی ہجرت سے نمٹنے کے لئے دباؤ میں ہے. یورپی کورٹ آف آڈیٹرز (ای سی اے) کی رپورٹ میں کہا گیا ہے کہ ترکی میں این جی اوز کے لیے آپریٹنگ ماحول 2015 کے بعد سے خراب ہوا ہے، اور ناکام بغاوت کے بعد صورتحال مزید مشکل ہو رہی ہے۔ رپورٹ میں ترکی کی معاشی بدحالی اور قانون کی حکمرانی اور بنیادی حقوق پر انقرہ کی پسپائی کے دوران یورپی یونین کی امداد کے انتظام میں مشکلات پر روشنی ڈالی گئی ہے۔ یورپی یونین کے ایگزیکٹو ادارے یورپی کمیشن پر تنقید کی گئی کہ وہ اخراجات کا واضح تجزیہ فراہم کرنے میں ناکام رہا اور یہ واضح نہیں تھا کہ امداد ختم ہونے کے بعد کیا ہوگا۔ ای سی اے کی رپورٹ کی قیادت کرنے والی بیٹینا جیکوبسن نے ترکی میں پناہ گزینوں اور میزبان کمیونٹیوں کے لئے یورپی یونین کی امداد کی سہولت کے لئے اثر و رسوخ کو ظاہر کرنے ، پائیداری کو یقینی بنانے اور قیمت کے لئے قیمت کو بہتر بنانے کی ضرورت پر زور دیا۔ انسانی حقوق کے گروپوں اور کچھ سیاستدانوں نے یورپی یونین پر تنقید کی ہے کہ وہ انسانی حقوق کے خدشات سے زیادہ غیر قانونی ہجرت کو کم کرنے کو ترجیح دے رہی ہے۔ برسلز اسکول آف گورننس کے پروفیسر فلورین ٹراونر نے کہا کہ اس توجہ کا نتیجہ یہ ہے کہ یورپی یونین انسانی حقوق کے مسائل کو نظر انداز کر رہی ہے۔ یورپی یونین کے اومبڈسمین، ایملی او ریلی نے تیونس کے ساتھ یورپی یونین کے نئے ہجرت کے معاہدے کے تحت انسانی حقوق کے تحفظ کے بارے میں تحقیقات شروع کی ہیں.