تم اختيار المركز بسبب خبرته في المسائل الفكرية والتماشى مع هدف المؤتمر من جسر الطوائف الإسلامية. تم تعيين ثلاث هيئات بحثية للمساهمة في المؤتمرات المستقبلية من خلال البحث في أصول وفروع طوائف إسلامية محددة. ويركز مركز حماية الفكر على أهمية الخطاب الإسلامي الشامل والقصير والواسع والصريح. يصف النص نهجا إسلاميا يعزز الاعتدال والتنوع والوحدة، وتجنب الاستبعاد والفصام داخل المجتمع الإسلامي. يدعم العلماء هذا النهج، مؤكدين على أهمية تجنب العلامات التي تعرقل التعاون والتفاهم، ولا سيما فيما يتعلق بقضايا مثل التطرف. خلال مؤتمر في مكة المكرمة، اعترف المشارون بتمييز مختلف المدارس الإسلامية الفكرية ولكنهم شددوا على الحاجة إلى موقف موحد بشأن القضايا الرئيسية، مثل مكافحة الطائفية والتطرف الفكري. وأشاروا إلى أن منظمات مثل منظمة التعاون العالمي الإسلامي والراب الإسلامي ساعدوا في إقامة "إجماع فكري".